武汉市畜牧兽医科研所,华中农业大学,剑桥大学-University of Cambridge 在2006年1月至2008年12月期间,合作共同完成了武汉市科技局2006年武汉市国际合作项目“采用高通量的基因芯片新技术筛选猪抗病基因标记及其应用的研究”(项目编号:20067003111-06,下达文号:武科[2006]41号文),
主要研究成果和创新
1.以7个中外猪品种DNA为研究对象,在19个在感染PRRS病毒的巨噬细胞中存在表达差异的候选基因(Mx1, GPR30, IL12RB2, IL10, CXCL12, TLR4, FUT1, RYR1, ESR, FSHB, PRLR, BCL11A, BCL11B, Sn, CD136, CD163基因, 三个SLA区域基因: SLA-3, EHMT2, BAT2) 中进行检测, 发现了25个新的单核苷酸多态性SNP位点;
2.根据本课题组以前研究结果和相关文献,筛选了免疫相关412个功能基因,并在全基因组范围内, 筛选出了3120个SNP位点, 用于制作芯片探针;
3.利用基因芯片(微点阵法)技术,对7个品种的698头猪进行基因分型,检测了18个SNP中的12个SNP, 并分析了7个品种猪的等位基因频率;
4.用基因芯片技术检测了4000头猪的的SNP和基因分型,并与相关的表型性状进行关联分析,结果初步表明:SNP基因位点与猪呼吸与繁殖综合症(猪蓝耳病,PRRS)临床症状显著相关, 筛选出7个与猪蓝耳病 (PRRS) 临床症状相关的SNP位点标记.分别为: 在P1-IL12RB2和P2-IL12RB2标记中, 11和12为有利基因型, 22为不利基因型;在P1-IL10, P2-IL10, P1-BAT2, P2-EHMT2标记中, 12和22为有利基因型, 11为不利基因型; 在P2-CXCL12标记中, 11和 22为有利基因型, 12为不利基因型;
5.应用SNP位点标记, 分析了7个中外猪品种的829头猪SNP位点的变异和抗病性能。RYR位点 可能用于判断抗应激性能; FUT1基因位点可能用于判断大肠杆菌性能;
6.应用筛选出的SNP位点标记, 利用基因芯片分析了178头猪SNP位点的变异及其与伪狂犬病 (Prv) 抗体相关性。P2-EHMT2可能用于判断抗体高低的标记;
7.与英国剑桥大学联合培养了一名博士生 (袁金锋), 培养了2名硕士生; 8.发表了4篇论文 (其中1篇英文), 还有4篇正在投稿中 (1篇英文) 。